商铺40年产权到期后，可以采取以下步骤进行续期：
提前申请续期：
商铺土地使用权到期前一年，产权人需要向有关部门提出书面申请续期。
缴纳续期费用：
续期时可能需要缴纳一定的手续费用，续期费用的缴纳或减免，依照法律、行政法规的规定办理。
重新签订土地使用权出让合同：
获批续期后，土地使用者需要按照相应规定重新与相关机构签订土地使用权出让合同，并且按照约定金额支付土地使用权出让金。
办理续期手续：
商铺土地使用权到期后，如果不再续期，国家无偿收回土地使用权，包括地上的房屋。可以到有关部门进行续期，可能需要缴纳一定的手续费用。续期以后，房子还是自己的。
考虑规划因素：
如果国家有其他规划需要收回土地和地上建筑物，业主也可以得到相应的经济补偿，用类似拆迁安置的办法解决。
总结来说，商铺40年产权到期后，产权人需要提前申请续期并支付相应的土地出让金，以重新获得土地使用权。如果国家有其他规划需要收回土地，业主还可以获得相应的经济补偿。
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