黄灯直行是否算违章，需要根据具体情况来判断：
黄灯亮起时已经越过停止线的车辆可以继续通行：
根据《道路交通安全法实施条例》的规定，黄灯亮时，已经越过停止线的车辆可以继续通行。因此，如果车辆在黄灯亮起时已经越过停止线，那么直行通过不算违章。
黄灯闪烁时，确认安全后可以通行：
如果黄灯一直在闪烁，提示车辆和行人注意瞭望，确认安全后可以通过，这种情况也不算违章。
黄灯亮起时未越过停止线的车辆应停止：
如果车辆在黄灯亮起时未越过停止线，则应当停止，否则可能被视为闯红灯。
黄灯进入直行待行区不扣分：
如果车辆在黄灯亮起时进入直行待行区，并不扣分，但应当遵守交通信号灯和标志的规定。
综上所述，黄灯直行是否算违章，主要取决于车辆是否在黄灯亮起时已经越过停止线。如果已经越过停止线，可以继续通行；如果未越过停止线，则应当停止。此外，如果黄灯一直在闪烁，确认安全后也可以通过，不算违章。
建议驾驶员在遇到黄灯时，首先要判断自己的车辆是否已经越过停止线，并根据实际情况做出相应的处理，以确保行车安全并遵守交通规则。
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